美國(guó)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)學(xué)會(huì)（ACMG）的臨床遺傳學(xué)年會(huì)于3月24-28日在美國(guó)鹽湖城舉行。加州大學(xué)舊金山分校的Robert Nussbaum在會(huì)議上表示，高通量的外顯子組測(cè)序有望作為輔助的篩查檢測(cè)，發(fā)現(xiàn)新生兒的代謝疾病。
　　四家機(jī)構(gòu)最近發(fā)起了一項(xiàng)稱為“NewbieSeq（NBSeq）”的計(jì)劃，致力于探索新生兒測(cè)序的方方面面。他們希望將序列數(shù)據(jù)與質(zhì)譜圖相結(jié)合，以減少那些被誤認(rèn)為是患有代謝疾病的健康新生兒數(shù)量。
  Nussbaum正在評(píng)估測(cè)序是否能作為手段，來增強(qiáng)代謝疾病的篩查。他認(rèn)為，目前基于測(cè)序的檢測(cè)并不能滿足群體篩查項(xiàng)目的需求，找到在特定疾病上具有風(fēng)險(xiǎn)的個(gè)體。在理想情況下，篩查工具應(yīng)當(dāng)以低廉的價(jià)格提供高通量的結(jié)果，通過假陽性低的檢測(cè)篩查出盡可能多的高危個(gè)體。
　　不過Nussbaum及其同事相信，測(cè)序有望作為二線檢測(cè)，以便在篩查檢測(cè)結(jié)果返回給醫(yī)生之前減少假陽性的數(shù)量。
  一般來說，先天性代謝異常的篩查是通過串聯(lián)質(zhì)譜的檢測(cè)來完成的。這種檢測(cè)關(guān)注與脂肪酸代謝疾病相關(guān)的十幾種氨基酸以及?；鈮A。盡管質(zhì)譜篩查的方法已經(jīng)成熟，但假陽性仍然是個(gè)問題，特別是對(duì)于NICU的新生兒，他們因?yàn)槌錾w重不足或早產(chǎn)而表現(xiàn)出代謝失衡。
  研究小組推斷，加入相關(guān)基因的序列信息，可能有助于增強(qiáng)NICU中新生兒的篩查特異性。Nussbaum指出，除了有望降低最終報(bào)告給醫(yī)生的假陽性數(shù)量，測(cè)序和質(zhì)譜分析可同時(shí)開展，而兩種類型的數(shù)據(jù)從理論上加入調(diào)整后的篩查算法。
  對(duì)于NBSeq項(xiàng)目，研究人員計(jì)劃對(duì)1600個(gè)血斑樣本進(jìn)行外顯子組測(cè)序，這些血斑來自于兒童，但去除了識(shí)別信息，包括質(zhì)譜篩查獲得了假陽性還是假陰性的結(jié)果。這項(xiàng)遺傳分析將集中在大約250個(gè)基因 – 其中44個(gè)在代謝疾病中發(fā)揮作用，而數(shù)百個(gè)基因通過通路分析精確定位。
  盡管最初的變異分析是在不知道個(gè)體表型的情況下進(jìn)行的，但研究小組計(jì)劃最終將基因分型數(shù)據(jù)與表型數(shù)據(jù)相關(guān)聯(lián)。
  隨著測(cè)序有望作為二線篩查，研究小組也希望能夠更清晰地了解那些參與代謝疾病的變異。至于研究過程中鑒定出的致病變異是否要加入NCBI的ClinVar數(shù)據(jù)庫，目前還有待確定，因?yàn)檫@需要加利福尼亞公共衛(wèi)生部門的許可。